[DDBJデータ解析チャレンジ 2016] DNA配列からのクロマチン特徴予測

※このコンペティションはDDBJ Data Analysis Challengeとして開催しております。
詳細はhttp://www.ddbj.nig.ac.jp/ddbj-challenge2016-j.htmlを御参照ください。
DDBJ データ解析チャレンジ同意書

DDBJでは、高速DNAシークエンサ由来のビッグデータDDBJ SRAを提供しています。このコンペティションでは、SRAを再解析したクロマチン特徴注釈データ(ChIP-Atlasデータベース)を用いて、入力DNA配列に対応するゲノム領域にクロマチン特徴領域が含まれるか否かを予測します。クロマチン特徴領域は遺伝子発現のオンオフ機能に関係する領域であり、ChIP-Atlasデータベースでのピーク領域に相当します。ChIP-Atlasでは組織(CellTypeクラス)や機能種類(Antigenクラス)により条件が設定されています。課題データは8条件で構成されています。

問題の種類
分類
評価指標
平均ROC-AUC
状態
終了
開始日時
2016/07/06 00:00 (Japan Standard Time)
終了日時
2016/08/31 23:59 (Japan Standard Time)
公開設定
公開(誰でもコンペティションの内容を閲覧できます)
参加者制限
制限なし(ユーザ登録済みであれば誰でもコンペティションに参加できます)

予測用データのダウンロード・予測結果の提出

コンペティション開催期間中以外は、データダウンロード・予測結果提出をすることはできません

最終ランキング

最終順位 提出者 最終スコア 中間スコア
1 MochizukiM 0.94564 0.94403
2 aaaaaaa 0.89859 0.89694
3 BITS-TO 0.85428 0.85562
4 orion 0.84791 0.85140
5 Ktakuya 0.84318 0.84548
6 Ryota 0.83792 0.83687
7 tsukasa 0.83464 0.83375
8 emn 0.83318 0.83578
9 ηzw 0.82746 0.82820
10 mkoido 0.81279 0.81045
11 ksh 0.81185 0.81506
12 AoYu@Tohoku 0.80890 0.81087
13 hiro 0.80845 0.81436
14 emihat 0.80602 0.81027
15 MorikawaH 0.80544 0.80469
16 hmt-yamamoto 0.79993 0.79833
17 yuifu 0.79558 0.78738
18 tonets 0.78787 0.79107
19 すずどら 0.78773 0.79088
20 take2 0.78039 0.78476
21 bicycle1885 0.77276 0.78045
22 morizo 0.76511 0.76901
23 forester 0.76022 0.75673
24 どいやさん 0.75833 0.75549
25 yudai 0.73278 0.73422
26 tag 0.71079 0.71853
27 nwatarai 0.66467 0.66085
28 soki 0.65225 0.65021
29 himkt 0.64982 0.64769
30 admin 0.63484 0.63324
31 saoki 0.63470 0.63322
31 tsunechan 0.63470 0.63322
31 Ken 0.63470 0.63322
34 A.K 0.60891 0.60364
35 singular0316 0.58998 0.58843
36 IK 0.52929 0.53703
37 yk_tani 0.50227 0.50350
38 yota0000 0.50000 0.50000
39 extraterrestrial Fuun species 0.16702 0.16516

ランキングには、最新提出モデルのスコアが表示されます。
中間スコアはテストデータの50%を使って算出されます。最終スコアは残りの50%を使って算出されます。
最終順位は最終スコアによって決定されます。

スコアの推移(最終スコア)

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